O Deportivo Cuenca foi criado em 2017 buscando cumprir as exigências feitas pela Federação Equatoriana de Futebol, no qual as equipes tradicionais masculinas deveriam criar suas equipes de futebol feminino. O clube firmou uma parceria com a Escola de Futebol de Mayta Vásconez, no qual essa instituição ficou responsável por todas as categorias de futebol feminino, enquanto isso o Deportivo Cuenca fornecia todos aparatos esportivos.
Na teoria está será a estreia do Deportivo Cuenca na Libertadores Feminina, porém na prática é uma equipe formada por jogadoras com bastante experiência nesta competição. No início do ano o clube Union Española, que havia disputado as três últimas edições da Libertadores representando o Equador, decidiu encerrar suas atividades. Sendo assim, o Deportivo Cuenca herdou a vaga desta equipe na primeira divisão, além de assumir praticamente todo o elenco do extinto clube.
Nesta temporada o clube se sagrou, pela primeira vez, o grande campeão do
Campeonato equatoriano de futebol feminino. Na final, mais de 15 mil
torcedores estiveram presentes no Estádio Alejandro Serrano Aguilar, para ver a equipe levantar o título. Muito deste êxito se deve a treinadora da equipe e, também, da seleção equatoriana de futebol feminino, Wendy Villón.
Madelin Riera é a principal expoente da equipe do Cuenca. Nesta temporada a atacante conseguiu quebrar o recorde de gols da história da liga equatoriana, seja feminina ou masculina, foram 44 gols em 26 partidas disputadas.
Outras jogadoras a se observar são a lateral Nicole Charcopa, a meio-campista, Ericka Gracia e a atacante Gianina Lattanzio.
Data de criação: março de 2017
Nível de competitividade: 2 / 5
Como se classificou para a Libertadores: Campeã equatoriana.
Número de participações: Estreante
Craque do time: Madelin Riera
Projeção na competição: Briga por vaga para as quartas